-1re session: F = 1/3 CC + 2/3 EE Brock Biology of microorganisms, Michael Madigan and Martinko john Elle comprend des cours/séminaires sur les acteurs moléculaires (récepteurs de reconnaissance de pathogènes, inflammasome, cytokines, synapse immunitaire) et cellulaires (NKT, DC, NK) des réponses immunitaires ainsi que sur différents mécanismes immunologiques (sélection thymique, tolérance…). Modélisation par des lois usuelles Ces micro-organismes ont évolué tout en interagissant avec le monde inorganique et avec les système équilibré d'eau et de substances abiotiques, de producteurs, de consommateurs et de Le comportement animal. -Génétique 25 h de travaux pratiques complètent cette formation théorique. The course is organized over an 8-week period at a rate of one day per week. L’analyse de grands jeux de données est un défi de la biologie actuelle. - Analyse critique d’illustrations de voies de signalisation et exercices de simplification D’autres TP sont consacrés à l’identification de structures cérébrales (souris), à l’enregistrement de l’activité électrique par électroencéphalogramme (homme), à l’étude de la signalisation de l’insuline par Western blot (souris) et à l’enregistrement de l’activité neuronale par la technique du patch clamp (souris). Systems Biology I Les bases de neurobiologie cellulaire : To this end they must write a CV, consult the internship offers and contact research teams of their choice for an interview. L’organisation et la structure des composants membranaires, ainsi que les mécanismes moléculaires gouvernant la fusion/fission membranaire seront développés au cours de cette UE. Ils devront choisir un article scientifique et une revue proposés par les enseignants et présenter oralement, à l’aide d’un support PowerPoint, le contenu de l’article en explicitant la pertinence de la question posée et de la stratégie expérimentale mise en œuvre. Charlotte Prieu (UVSQ), Fabienne Audebert (Sorbonne Universités), Catherine Bourguoin (Institut Pasteur), Sarah Bonnet (INRA). Paraplégies spastiques familiales A l’issue de cet enseignement, les étudiants auront approfondi leurs connaissances dans trois phénomènes fondamentaux de l'immunologie : la différenciation lymphocytaire (exemple: la différenciation des lymphocytes T et de la sélection thymique), la mise en place de la réponse immunitaire innée et de la réponse immunitaire adaptative. Chaque journée sera dédiée à un thème pour lequel, les étudiants aborderont le traitement théorique et la mise en œuvre pratique. 5-Elaborer une démarche expérimentale visant à répondre à une question biologique ayant trait au développement. 1. CM : 16h, TD : 9h, all : 25h. 1PUPH François Vialard Pour ce faire, ils doivent rédiger un CV, consulter les offres de stage et contacter les équipes de recherche de leur choix pour un entretien. Le parcours de M1 se construit sur une année. Johann Peltier A la fin du cours les étudiants seront en mesure de. Analyse, interpret and mobilize certain concepts in biology through active participation in group discussions on diverse themes including, second messenger systems, cell-cell communication, behaviour …, OAV2 HIV-associated chronic immune activation. Le concept de « Masteriales » vise à faire concevoir par les étudiants en petits groupes, un projet de recherche thématique et/ou technologique innovant dans un temps limité (48h) et de le présenter de façon argumentée devant un jury de scientifiques académiques et du privé. II. Les étudiants analysent des publications scientifiques et les présentent. The Scientific Project is organized over a period of 8 weeks at a rate of one day per week spent in the host laboratory. S. Szuplewski, MCU UVSQ. Bases en outils bioinformatiques pour collecter des informations sur un gène à partir de son numéro d’accession. A l’issue de l’UE, l’étudiant sera en mesure de : -Suivre rigoureusement un protocole expérimental en biologie végétale Two general references on these approaches : Analysis of scientific papers concerning the main course topics. 5. Corrélation / régression OAV1. être inscrit en M1 ou équivalent -Partiel de 1re session sous forme d'un examen écrit (EE) - Partiel de 1re session sous forme d'un examen oral (EO) et écrit (EE) 2008 Feb;12(1):93-101. Objectifs d’Apprentissage Visés : Bâtiment Bréguet -master scientific methods and experimental procedures commonly used in LSH Un des thèmes traités au cours des deux semaines devra être présenté oralement. - Autonomously read, understand and criticize developmental genetics articles. En s’appuyant sur des exemples, différentes applications actuelles dans le domaine de la génomique évolutive seront présentées sous forme de cours intégrés tout en abordant les aspects fondamentaux de cette discipline. C. Tissus artificiels et organoïdes L’environnement physique Lorsqu’ils interagissent entre eux et avec d’autres organismes dans les Kaplan et M. Delpech, ed : Flammarion Les analyses d’article seront présentées en binôme lors des séances de TD devant les autres étudiants. (a) disposer d’une vision d’ensemble d’un éventail actualisé d’outils de biologie moléculaire et biochimie permettant : (i) d'exprimer une protéine recombinante en système procaryote en répondant à divers objectifs d’un cahier des charges (niveau d’expression, localisation, détection et purification) ; (ii) de la purifier par différentes techniques de chromatographie et de la caractériser L’UE est composée de cours magistraux (40h) et de travaux dirigés (10h) dispensés par des intervenants (enseignants-chercheurs et chercheurs). La microbiologie est à la base de la biotechnologie moderne plusieurs centaines d'exemplaires au cours de sa vie), était un instrument à une seule lentille, une loupe de très courte distance focale. e) de synthétiser des informations pour les restituer oralement. Applications of animal transgenesis in research: -Systèmes pour l’encapsulation et la délivrance C. The approaches of the anti-cancer gene therapy Pr. L'examen terminal est une session écrite d'1h30 comportant plusieurs questions de cours et une analyse de résultats expérimentaux; il a lieu mi-avril. Connaissances de neurobiologie cellulaire et de neuroanatomie fonctionnelle niveau licence 3ième année (voir bibliographie). Cinétique des Traceurs (CM) - Décrire les notions fondamentales d'optique nécessaires à l'obtention d’images de matériels biologiques Enfin, sont enseignées les diverses étapes de la cancérogénèse et les thérapeutiques anticancéreuses dans ses aspects fondamentaux. pendant et après le stage, l'étudiant peut contacter le(la) responsable pour lui demander conseil sur l'élaboration de son poster. Analyser et interpréter des données expérimentales pour démontrer le rôle de certaines structures dans l’activité locomotrice et l’apprentissage moteur (cervelet), OAV3 -Système immunitaire et vieillissement Les cours, présentés par des chercheurs sous l’angle de la prévention nutritionnelle, abordent les aspects de santé humaine, les mécanismes physiologiques, cellulaires et moléculaires impliqués, et les stratégies de recherche mises en place. Given that the teaching unit is entirely in English, students are required to attest to a B2 level to participate. Dr Hind Guenou. Deux exemples de pathologie : la leucémie aiguë promyélocytaire et la leucémie myéloïde chronique 2 PR Marie-Noelle Dieudonné, Anne-Marie Prêt Les formes de vie extrêmes. The expected learning outcomes of the course are profiled in advanced and their completion monitored throughout time. e) complete a research funding application. 2 semaines consécutives de Travaux pratiques : They should also be able to describe the main physiological mechanisms of innate and adaptive immunity. -Concevoir un exposé oral sur une technique de biologie cellulaire ou moléculaire 1/ la régulation de la prise alimentaire, dans ses multiples dimensions (digestive, homéostatique, hédonique) en lien avec la question de l’obésité. •Anatomie et physiologie humaine, Elaine Marieb Le but de ce TP est d'établir un diagnostic en compilant les données expérimentales et des données théoriques. Décrire et formaliser les fondements de la perception sensorielle This course will also be available to PhD students depending on available places. - plateforme Biochimie Biotechnologie: Philippe Minard philippe.minard@universite-paris-saclay.fr, Hermann van Tilbeurgh herman.van-tilbeurgh@universite-paris-saclay.fr * Plasticité cellulaire et régénération ACS Chem Biol. GONAD: Genome-editing via Oviductal Nucleic Acids Delivery system: a novel microinjection independent genome engineering method in mice. 2- Stem Cell Technology and Regenerative Medicine: 2. Curr Opin Biotechnol. It was therefore necessary to integrate the Students will be required to complete a research tender dossier (eg simplified research grant format) which will be sent one week later to the head of the unit. vidéo, animation). Cet enseignement pratique est concentré sur deux semaines successives. Décrire les processus et expliquer les notions fondamentales présentées en cours de Biochimie-Signalisation, Biologie cellulaire, Génétique-Génomique. Pour bénéficier pleinement des enseignements de cette UE, les étudiants doivent maitriser les bases de: This course offers a broad vision of Evolution by exploring “the tree of life”. C.Artificial tissue and Organoids 4) Microscopie électronique (ultra-structurale et moléculaire) • L’étude de la diversité métabolique. Example of a technique of gene transfer in embryo: - de décrire et comparer la structure et les modalités de multiplication des principaux virus étudiés (rétrovirus, adénovirus, inovirus, herpèsvirus, rhabdovirus) ; - Les ultrastructures bactériennes Chapitre 1 : Introduction à la microbiologie La miroiologie est la sien e qui s’intéresse aux êtres vivants dont la taille est de l’ordre du micromètre. Cours et conférences (35h) complétés par des séances de travaux dirigés (8h) au cours desquelles sont étudiées et discutées des données issues d’articles scientifiques dans le domaine. Les règles précises sur la construction du parcours individuel sont accessibles via un outil dédié: http://parcours-biologie-sante-paris-saclay.ens-cachan.frfr. Besoins nutritionnels et énergétiques de base, phototrophie, chimiothotrophie, aérobiose, anaérobiose, fermentation. Emmanuel Culetto (UPSay) Modalité du contrôle des connaissances (MCC) : Jeremy N. S. Evans B. Les approches en immunothérapie anticancéreuse -Expliquer les principes et les méthodes d’étude électrophysiologique des canaux ioniques. Elle comprend également des exposés portant sur la mort cellulaire et des séances de restitution et d’analyse des résultats expérimentaux. Hélène Vanacker, MCF Université Paris Sud. Réponses régulatrices At the end of the course, students will be able to: Supports autorisés : ordinateur portable ou transparents (un vidéo-projecteur sera fourni). Les étudiants doivent maitriser : Reconnaître et représenter la topologie d’une protéine membranaire ; définir les principales caractéristiques structurales des protéines membranaires, illustrer et expliquer les méthodes d’études de base des protéines membranaires. Oliver Nüsse (UPSay) For instance, relevant publications are: Elle permettra aux étudiants de gagner en autonomie pour définir la/les expériences à réaliser pour répondre à une problématique scientifique dans ce domaine. La première semaine concerne l'ensemble des étudiants suivant l'UE et permettra de donner les bases bibliographiques et théoriques nécessaires à la compréhension des ateliers sous forme de cours. Thérapie génique: Systems Biology [Textbook], E. Klipp et al, Wiley-Blackwell, 2011. 3/ le rôle des lipides dans les fonctions cérébrales De Boeck Université. - identifier les idées principales d’un article scientifique ; Overview: Jean-Marc Verbavatz Des techniques couramment utilisées en pathologie végétale sont mises en œuvre en TP pour caractériser le niveau de résistance différents génotypes de la plante modèle Arabidopsis thaliana à différents agents pathogènes. Les expériences se déroulent en continu, entrecoupées par des temps de présentation et d’explication des protocoles, ainsi que des mises au point et des rappels théoriques en biologie moléculaire et biochimie concernant les thèmes abordés au cours de ces TP. - EpiGensSys European Network Website: http://www.epigenesys.eu/fr/ - Biologie Moléculaire du gène de Watson J., Baker T., Bell S., Gann A., Levine M. et Losick R. ed : Pearson. - Pathologies en endocrinologie liées à la dérégulation de la signalisation cellulaire Ken Olaussen. Structure and mechanism and protein function. L'objectif de cette UE est de présenter et d'analyser ces nouvelles données en mettant l'accent sur l'apport des différents modèles et sur la comparaison des mécanismes impliqués dans le vieillissement et le contrôle de la longévité. Stratégies vaccinales (2h) Course material will be distributed to students before the start of the teaching unit by way of the e-campus platform. trinômes). 2012, 7:1935?49. 5th Edition or more recent international journals referenced in Pubmed) to draw inspiration from current scientific, medical and technological advances. Deux portant sur les modèles viraux étudiés dans l’UE (virus de la rougeole et VIH) et la troisième ayant pour objectif de sensibiliser les étudiants aux problématiques de niveaux de risques et de confinements rencontrées dans les laboratoires manipulant des virus et plus généralement des agents biologiques. - write a laboratory notebook 1.Décrire les éléments de structure d’une protéine et de les comparer 1 intervenant CEA. In particular, students should be able to identify the main cells and molecules involved in immune responses. Les propriétés biophysiques et structurales des protéines de la banque seront étudiées lors d’analyses sous forme d’un TD de données biophysiques publiées (dichroïsme circulaire, microcalorimétrie) et d’études structurales in silico en utilisant des logiciels de visualisation de structures (PyMOL). reproduction : folliculogenèse et spermatogenèse; Régulation hormonale du métabolisme glucidique et lipidique; Empreinte métabolique; Adiponectine et homéostasie énergétique; Régulation hormonale du métabolisme protéique; Rôle du CNTF dans la régulation de la prise alimentaire; Neuroinflammation et hypothalamus; Régulation centrale de la prise alimentaire/ Insuline et leptine; Surrénales; Hypothalamus et lipotoxicité; Biosynthèse des stéroïdes et Pierre Capy: mailto:pierre.capy@universite-paris-saclay.fr La formation comporte : - Approches thérapeutiques à l’aide de petits ARNnc. Virus à ADN Complexes ... • Présents dans l'environnement humain, notamment dans les plantes, les fruits, la poussière, l'air. The platform also offers a broad range of practical courses enabling students to work on microbiological topics thanks to various techniques (microbiology, biochemistry, molecular biology, RNA interference, genetic engineering) according to different study models (bacteria, yeast, protists, viruses). Ils sauront identifier les molécules et les cellules impliquées dans ces phénomènes. L’ensemble du travail sera synthétisé dans un document présentant la démarche expérimentale, les données récoltées et leur analyse. Maladies autoimmunes (2h) Après cette étape de compréhension de l’article, les étudiants rédigent ensuite chez eux un manuscrit sur l’article travaillé en TD en vue de sa publication par Médecine/Sciences. - Develop good laboratory practices for cells culture Marianne Malartre 630, université Paris Sud/Paris Saclay, Orsay). From Molecules to networks, an introduction to Cellular and Molecular, J. H. Byrne-J. Décrire l’action des antidépresseurs chez l’homme et dans des modèles animaux de dépression. Utiliser des outils informatiques adaptés pour collecter et/ou traiter les données expérimentales dans les trois disciplines du socle. -Décrire différentes approches pré-cliniques permettant d’étudier des réseaux neuronaux impliqués dans les épisodes dépressifs caractérisés. En s’appuyant sur les enseignements dispensés, l’étudiant sera capable d’interpréter, d’analyser et d’argumenter des articles scientifiques, afin de pouvoir animer une discussion scientifique, tout en gardant un esprit à la fois ouvert et critique. - Keijzers G, Bakula D, Scheibye-Knudsen M. Monogenic Diseases of DNA Repair. Les règles précises sur la construction du parcours individuel sont accessibles via un outil dédié: http://parcours-biologie-sante-paris-saclay.ens-cachan.fr. Matrices Problèmes inverses (CM) SCEAUX - ORSAY - GUYANCOURT - EVRY - GIF-SUR-YVETTE - CHATENAY - VERSAILLES - PARIS - KREMLIN-BICETRE - ST-QUENTIN-EN-YVELINES - PALAISEAU - MONTIGNY-LE-BRETONNEUX - COURCOURONNES - BURES-SUR-YVETTE - JOUY-EN-JOSAS. -Définir les épisodes dépressifs caractérisés et les différentes classes d’antidépresseurs. -Utiliser un spectrophotomètre dans différents modes d’acquisition -Définir les différentes approches permettant d'exprimer des protéines recombinantes, choisir le système d'expression adapté en fonctions des caractéristiques des protéines et des applications envisagées. •utilisera la plate-forme Galaxy pour traiter les données de séquençage de l’ADN Structure des protéines Le nombre total d’heures d’enseignement est de 36h. • Microbiologie OAV3. Comprendre le role des acteurs de l'épigenèse dans la differenciation et la prolifération cellulaire et leur implication dans le développement des cancers. Introduction à la démarche Qualité, aux normes et à la réglementation en vigueur dans les entreprises agro-alimentaires et pharmaceutiques. Les modalités d'examen consistent en un examen écrit et un contrôle continu basé sur un article préalablement fourni. -Choisir et exploiter des banques de données de séquences et réaliser des comparaisons de séquences en utilisant le programme Blast approprié pour identifier un gène à partir d’une séquence nucléique
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